دکتر مسعود پزشکیان، وزیر بهداشت و درمان کشور در دوران دولت خاتمی از روند اجرای طرح تحول نظام سلامت انتقاد کرده و می گوید:

این طرح کاملا غیرعلمی و غیرکارشناسی است.